Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms