Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnih3Q6ZWS4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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