Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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