Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim24Q64127 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim24Q64127 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim24Q64127 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim24Q64127 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim24Q64127 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim24Q64127 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim24Q64127 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim24Q64127 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim24Q64127 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim24Q64127 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim24Q64127 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim24Q64127 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim24Q64127 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim24Q64127 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim24Q64127 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms