Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa17Q64016 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms