Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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