Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms