Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam71bQ5STT6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms