Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rbm27Q5SFM8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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