Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
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