Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms