Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms