Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms