Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3USZ8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3USZ8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3USZ8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3USZ8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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