Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms