Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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