Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms