Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms