Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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