Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms