Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rnf180Q3U827 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rnf180Q3U827 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rnf180Q3U827 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rnf180Q3U827 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Rnf180Q3U827 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Rnf180Q3U827 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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