Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q3U595 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q3U595 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q3U595 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms