Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec24aQ3U2P1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms