Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Kdm4dQ3U2K5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Kdm4dQ3U2K5 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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