Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms