Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Q3U1D9 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms