Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms