Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hdgfl1Q2VPR5 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl1Q2VPR5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hdgfl1Q2VPR5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hdgfl1Q2VPR5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hdgfl1Q2VPR5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hdgfl1Q2VPR5 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hdgfl1Q2VPR5 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hdgfl1Q2VPR5 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl1Q2VPR5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms