Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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