Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rpusd2Q149F1 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rpusd2Q149F1 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rpusd2Q149F1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rpusd2Q149F1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rpusd2Q149F1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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