Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms