Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms