Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms