Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Sh3bp2Q06649 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Sh3bp2Q06649 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Sh3bp2Q06649 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Sh3bp2Q06649 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms