Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gimap4-203ENSMUST00000118802 771 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Pfn4-201ENSMUST00000020967 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm22906-201ENSMUST00000175191 250 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms