Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms