Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms