Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms