Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms