Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SeleQ00690 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms