Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shc1P98083 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shc1P98083 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Shc1P98083 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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