Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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Arf1P84078 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Arf1P84078 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms