Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Otx2P80206 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx2P80206 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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