Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SbdsP70122 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SbdsP70122 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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