Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms