Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms