Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

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Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Csrnp3P59055 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Csrnp3P59055 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Csrnp3P59055 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Csrnp3P59055 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Csrnp3P59055 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Csrnp3P59055 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Csrnp3P59055 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Csrnp3P59055 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Csrnp3P59055 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Csrnp3P59055 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Csrnp3P59055 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Csrnp3P59055 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Csrnp3P59055 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csrnp3P59055 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms