Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms