Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmoP56726 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmoP56726 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmoP56726 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmoP56726 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmoP56726 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmoP56726 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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SmoP56726 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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SmoP56726 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmoP56726 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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