Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Abcd3P55096 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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